Organisation, contrôle et expression du génôme humain

Organisation, contrôle et expression du génôme humain
Master Biologie-santéParcours Recherche en biomédecine et sciences des données

Description

Ce cours donnera aux étudiants des connaissances approfondies permettant de mieux comprendre le fonctionnement du génome humain. Le cours s’articulera autour de deux axes intimement liés et complémentaires à savoir d’une part le génome à proprement dit et d’autre part l’expression des gènes et l’épigénétique. Le premier axe abordera l’organisation, la variabilité et l’évolution du génome humain (et autres génomes), le second axe sera focalisé sur la régulation de la transcription des gènes ainsi que l’organisation de la chromatine et l’architecture nucléaire.

Le but est de donner aux étudiants une compréhension globale de l’utilisation des informations contenues dans le génome humain. La présentation des connaissances se fera le plus souvent possible en expliquant les méthodes expérimentales utilisées.

Chaque bloc de cours magistral (environ 4 h) sera suivi d’une séance de présentation d’articles par les étudiants visant à vérifier l’acquisition des connaissances et à approfondir certains éléments en s’appuyant sur l’interprétation de résultats expérimentaux concernant les questions les plus actuelles du domaine. Ce cours vise donc à préparer les étudiants à une démarche de recherche expérimentale en intégrant, dans un ensemble de connaissances, de nouveaux concepts issus de résultats récents.

Compétences visées

A l’issue de ce cours l’étudiant est capable de :

  • connaitre l’organisation du génome humain, les différentes classes de gènes (codants et non-codants), les séquences uniques et les séquences répétées
  • comprendre les méthodes d’analyse du génome humain et les outils permettant d’interroger le génome humain (web browser…)
  • comprendre les méthodes d’analyse de l’évolution des génomes (génomique comparative, analyse d’organisme modèles…).
  • comprendre la place d’Homo Sapiens dans l’arbre phylogénétique.
  • connaitre la variabilité du génome humain et les principes guidant cette variabilité.
  • comprendre les conséquences de différents types de variations de séquence.
  • connaitre les mécanismes de base de la transcription chez les procaryotes et chez les eucaryotes.
  • connaitre les mécanismes de régulation de l’expression des gènes chez les procaryotes et chez les eucaryotes
  • connaitre la structure de la chromatine et les différents états de compaction du génome.
  • comprendre les mécanismes épigénétiques et le principe de transmission épigénétique.
  • comprendre le rôle de l’architecture nucléaire et de l’organisation tridimensionnelle du génome dans la régulation de l’expression des gènes

Modalités d'organisation et de suivi

Méthodes pédagogiques :
Présentation magistrale des connaissances, illustrée par de nombreux exemples issus de la recherche fondamentale. Le cours magistral est accompagné de :

  • Séances de pédagogie inverse réalisées en groupes d'étudiants sous forme de présentation d’articles liés à un thème donné.
  • Utilisation de la plateforme Moodle pour la mise en ligne des supports de cours et d’articles de synthèse pour l’approfondissement de certaines connaissances, des articles présentés lors de séances de pédagogie inverse.
  • Les annales seront mises en lignes


Travail personnel recommandé :
Pour chaque séance de présentation d’article, tous les étudiants doivent acquérir les connaissances du bloc d’enseignement correspondant et lire les articles.

Plan :
Chapitre 1 : Organisation des génomes – Le génome humain
Chapitre 2 : Méthodes d’analyse des génomes –Evolution des génomes
Chapitre 3 : Les principaux outils disponibles
Chapitre 4 : Variabilité du génome humain – Les grands programmes d’analyse
Chapitre 5 : Mécanismes de base de la transcription
Chapitre 6 : Régulation transcriptionnelle chez les procaryotes et les eucaryotes
Chapitre 7 : Structure de la chromatine et mécanismes épigénétiques
Chapitre 8 : Organisation tridimensionnelle du génome
 

Bibliographie

  • Human Molecular Genetics, Strachan and Reed, 4ième ed., Garland Science.
  • Molecular Biology of the Cell, Alberts et al., 6ième ed., Garland Science.
  • Molecular Cell Biology. Lodish et al., 8th edition, W.H. Freeman. Macmillan Learning.
  • Molecular Biology. Principles and Practice. Cox, Doudna, O’Donnell, 2nd edition. W.H. Freeman. Macmillan Learning.

Contacts

Responsable(s) de l'enseignement

Université numérique en santé et sport
Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg
Agence régionale de santé
Centre d'étude et de conservation des oeufs et du sperme
Institut de cancérologie Strasbourg
Institut hospitalo-universitaire
Établissement français du sang
Association amicale des étudiants en médecine de Strasbourg
Mouvement des étudiant.e.s alsacien.ne.s futur.e.s orthophonistes
Association strasbourgeoise des étudiants en Orthoptie
L'association Tutorat Santé de Strasbourg
Amicale des Étudiants Sages-Femmes d'Alsace
Réseau des Étudiants Soignants des Hôpitaux Universitaires de Strasbourg
Institut national de la santé et de la recherche médicale
Centre national de la recherche scientifique
Fédération de médecine translationnelle de Strasbourg
Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie
Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire
Centre de recherche en biomédecine de Strasbourg - CRBS
Conférence des doyens des facultés de médecine
Faculté de sciences de la vie
Faculté de chirurgie dentaire
Faculté de pharmacie