À la fin du Second Cycle l’étudiant choisit, en fonction de son classement aux épreuves classantes nationales (ECN), vers quel DES s’orienter. Pour chaque DES une maquette décrit le contenu de la formation et les stages obligatoires que doit valider l’interne. La formation universitaire est assurée par la Faculté sous la responsabilité du coordonnateur interrégional du DES.
Selon l’arrêté du 21 avril 2017 la liste nationale des 44 Diplômes d’Études Spécialisées qui peuvent être acquis dans le cadre du Troisième Cycle est fixée comme suit :
Discipline Chirurgicale
- Chirurgie maxillo-faciale
- Chirurgie orale
- Chirurgie orthopédique et traumatologique
- Chirurgie pédiatrique
- Chirurgie plastique, reconstructrice et esthétique
- Chirurgie thoracique et cardiovasculaire
- Chirurgie vasculaire
- Chirurgie viscérale et digestive
- Gynécologie obstétrique
- Neurochirurgie
- Ophtalmologie
- Oto-rhino-laryngologie – Chirurgie cervico-faciale
- Urologie
Discipline Médicale
- Allergologie (co-DES)
- Anatomie et cytologie pathologiques
- Anesthésie-réanimation (co-DES)
- Dermatologie et vénéréologie
- Endocrinologie-diabétologie-nutrition
- Génétique médicale
- Gériatrie
- Gynécologie médicale
- Hématologie
- Hépato-gastro-entérologie
- Maladies infectieuses et tropicales (co-DES)
- Médecine cardiovasculaire (co-DES)
- Médecine d’urgence
- Médecine et Santé au travail
- Médecine générale
- Médecine intensive-réanimation (co-DES)
- Médecine interne et immunologie clinique (co-DES)
- Médecine légale et expertises médicales
- Médecine nucléaire
- Médecine physique et de réadaptation
- Médecine vasculaire (co-DES)
- Néphrologie
- Neurologie
- Oncologie
- Pédiatrie
- Pneumologie
- Psychiatrie
- Radiologie et imagerie médicale
- Rhumatologie
- Santé publique
Discipline biologique
- Biologie médicale